Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apobec3Q99J72 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apobec3Q99J72 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms