Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ctu1Q99J10 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ctu1Q99J10 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ctu1Q99J10 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctu1Q99J10 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms