Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clip1Q922J3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clip1Q922J3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Clip1Q922J3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clip1Q922J3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Clip1Q922J3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Clip1Q922J3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Clip1Q922J3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clip1Q922J3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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