Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmco4Q91WU4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmco4Q91WU4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms