Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Stx18Q8VDS8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Stx18Q8VDS8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Stx18Q8VDS8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Stx18Q8VDS8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Stx18Q8VDS8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Stx18Q8VDS8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Stx18Q8VDS8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Stx18Q8VDS8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Stx18Q8VDS8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Stx18Q8VDS8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Stx18Q8VDS8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Stx18Q8VDS8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms