Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd300ldQ8VCH2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd300ldQ8VCH2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms