Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BbxQ8VBW5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms