Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms