Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CcsapQ8QZT2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms