Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hoxc12Q8K5B8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms