Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf39Q8K2Z2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms