Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stn1Q8K2X3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stn1Q8K2X3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms