Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc12Q8K2L8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc12Q8K2L8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms