Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud6bQ8K2H2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms