Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc28aQ8CEI3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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