Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rdh13Q8CEE7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rdh13Q8CEE7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh13Q8CEE7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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