Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lin52Q8CD94 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lin52Q8CD94 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lin52Q8CD94 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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