Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nhlrc3Q8CCH2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nhlrc3Q8CCH2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nhlrc3Q8CCH2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Nhlrc3Q8CCH2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlrc3Q8CCH2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms