Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin9Q8C735 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms