Protein–RNA interactions for Protein: Q8C050

Rps6ka5, Ribosomal protein S6 kinase alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka5Q8C050 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka5Q8C050 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rps6ka5Q8C050 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka5Q8C050 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms