Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctdsp2Q8BX07 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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