Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx17Q8BVL3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx17Q8BVL3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx17Q8BVL3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx17Q8BVL3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx17Q8BVL3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx17Q8BVL3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx17Q8BVL3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Snx17Q8BVL3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx17Q8BVL3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms