Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Q8BP99 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Q8BP99 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q8BP99 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q8BP99 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q8BP99 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q8BP99 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q8BP99 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Q8BP99 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Q8BP99 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q8BP99 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BP99 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BP99 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q8BP99 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BP99 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BP99 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BP99 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q8BP99 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8BP99 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Q8BP99 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Q8BP99 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8BP99 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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