Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfneQ80ZF2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfneQ80ZF2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfneQ80ZF2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfneQ80ZF2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfneQ80ZF2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfneQ80ZF2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IfneQ80ZF2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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IfneQ80ZF2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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IfneQ80ZF2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
IfneQ80ZF2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms