Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnf1Q7TSH7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms