Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp397Q7TNK4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp397Q7TNK4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms