Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sys1Q78S06 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sys1Q78S06 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms