Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tmed3Q78IS1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms