Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med16Q6PGF3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms