Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CtifQ6PEE2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CtifQ6PEE2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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