Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6PD19 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6PD19 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q6PD19 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q6PD19 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms