Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttbk1Q6PCN3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttbk1Q6PCN3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms