Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrcc1Q69ZB0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms