Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cntn4Q69Z26 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn4Q69Z26 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms