Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rapgefl1Q68EF8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rapgefl1Q68EF8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms