Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sdc3Q64519 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc3Q64519 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sdc3Q64519 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sdc3Q64519 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sdc3Q64519 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sdc3Q64519 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc3Q64519 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sdc3Q64519 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sdc3Q64519 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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