Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp248Q640N4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp248Q640N4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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