Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfe3Q64092 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tfe3Q64092 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms