Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ift52Q62559 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms