Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phox2aQ62066 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phox2aQ62066 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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