Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cln3Q61124 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cln3Q61124 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms