Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lamb3Q61087 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms