Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp4Q60972 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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