Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp1r1bQ60829 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppp1r1bQ60829 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms