Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csnk2a1Q60737 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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