Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Foxd4Q60688 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Foxd4Q60688 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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