Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tsr1Q5SWD9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms