Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ttc9Q3V038 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Ttc9Q3V038 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ttc9Q3V038 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc9Q3V038 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Ttc9Q3V038 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms