Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc27Q3V036 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms