Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm29609Q3UU56 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm29609Q3UU56 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm29609Q3UU56 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm29609Q3UU56 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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